相比傳統(tǒng)的紙質(zhì)保函，電子保函無需抵押、無需反擔保、無需凍結(jié)資金，辦理簡單便捷、方便查驗真?zhèn)?、全程電子留痕，還可以在交易監(jiān)管方面發(fā)揮出重要作用。在工程保證和涉及政府采購領域的投標保證、履約保證等領域，紙質(zhì)保函和保證金作為兩種擔保方式，一直是市場上通行的做法。

保證金制度一直備受業(yè)界詬病，企業(yè)因交納投標、履約等保證金，導致大量資金被占用，且周期很長、負擔很重，嚴重阻礙了企業(yè)，特別是中小微企業(yè)的發(fā)展，而且保證金被挪用等違規(guī)違法案例也屢屢發(fā)生。

與保證金制度相比，紙質(zhì)保函的使用，降低了公共資源交易平臺的管理成本，對緩解投標企業(yè)資金壓力起到了一定的作用。但紙質(zhì)保函仍存在很多漏洞，由于紙質(zhì)保函仍屬于實物保證憑證，沒有任何加密手段，在實際中存在無法驗明真?zhèn)蔚那闆r，很容易造假。同時，也不便于平臺方進行管理追蹤，招標人索賠的效率不高。