醫(yī)院設有冠心病中心、心律失常中心、急重癥中心、心力衰竭中心、肺血管病中心、高血壓中心、臨床藥理中心、血脂異常與心血管病診治中心、內(nèi)分泌與心血管病診治中心、血栓性疾病診治中心、特需醫(yī)療中心、成人外科中心、血管外科中心、小兒外科中心、術(shù)后恢復中心、麻醉中心、體外循環(huán)中心、放射影像中心、超聲影像中心、核醫(yī)學影像中心、功能檢測中心、臨床檢驗中心等臨床和醫(yī)技科室。

中國醫(yī)學科學院阜外醫(yī)院（以下簡稱阜外醫(yī)院），是三級甲等心血管病?？漆t(yī)院，目前正朝向綜合型醫(yī)院轉(zhuǎn)型發(fā)展。阜外醫(yī)院是國家心血管病中心所在地，是心血管疾病國家重點實驗室、國家心血管疾病臨床醫(yī)學研究中心建設承擔單位，是獲得全國首批“輔導類”國家醫(yī)學中心和全國國家醫(yī)學中心實質(zhì)落地項目建設單位，以診治各種復雜、疑難和重癥心血管疾病而享譽國內(nèi)外，已成為世界上的心血管疾病診治中心和集醫(yī)療、科研、預防和人才培養(yǎng)于一體的醫(yī)學研究與教育中心。

阜外醫(yī)院現(xiàn)有病房39間，手術(shù)室27間（含多模態(tài)手術(shù)室1間），復合手術(shù)室6間，導管室18間（含日間手術(shù)室1間），編制床位數(shù)1521張，實際開放床位數(shù)1392張。阜外醫(yī)院將“持續(xù)建設、完善‘以心血管學科為引領，相關學科協(xié)調(diào)發(fā)展’的布局，為推動未來向綜合性醫(yī)院轉(zhuǎn)型奠定基礎”視作為核心發(fā)展目標之一，科學合理地調(diào)整學科配置及規(guī)模，現(xiàn)有臨床中心涵蓋心血管內(nèi)科、外科疾病診療中心、影像中心以及心血管相關疾病診療中心；新興學科包括腎內(nèi)科、呼吸內(nèi)科、神經(jīng)內(nèi)科、消化內(nèi)科、五官科、中醫(yī)科等。

豐厚的科研基礎條件與科研平臺

阜外醫(yī)院擁有心血管疾病國家重點實驗室、國家心血管疾病臨床醫(yī)學研究中心2個研究平臺，國家衛(wèi)生健康委心血管臨床研究重點實驗室、國家衛(wèi)生健康委心血管疾病再生醫(yī)學重點實驗室、心血管植入材料臨床前研究評價北京市重點實驗室、心血管疾病分子診斷北京市重點實驗室4個省部級研究平臺，以及中國醫(yī)學科學院冠心病風險預測與研究重點實驗室、中國醫(yī)學科學院肺血管醫(yī)學重點實驗室、中國醫(yī)學科學院心血管流行病學重點實驗室等7個醫(yī)科院級研究平臺。