北京兒童醫(yī)院擁有教育部兒科學(xué)國家重點學(xué)科和教學(xué)團隊，是首都醫(yī)科大學(xué)兒科醫(yī)學(xué)院和兒科學(xué)系所在地，現(xiàn)有教授、副教授116人，承擔(dān)著本科及博士、碩士研究生、七年制兒科專業(yè)，護理大專及繼續(xù)醫(yī)學(xué)教育等多層次教學(xué)任務(wù)，并設(shè)有博士后流動站，每年為社會輸送大量兒科人才。

北京兒童醫(yī)院積極發(fā)揮學(xué)科龍 頭作用，領(lǐng)航兒科行業(yè)發(fā)展。2013年牽頭組建北京兒童醫(yī)院集團，創(chuàng)新“病人不動、醫(yī)生移動”的模式服務(wù)全國患兒，目前理事單位成員已達57家。醫(yī)院與美國、俄羅斯、加拿大、意大利、澳大利亞、瑞典、德國、法國、日本、新加坡等國家的兒童醫(yī)療機構(gòu)和科研院所建立了良好的關(guān)系和廣泛的合作，是科技部認定的兒童重大疾病國際科技合作基地。

北京兒童醫(yī)院先后獲得“全國文明單位”“首都文明單位標兵”“首都文明服務(wù)示范窗口”“專科醫(yī)院”“雙十佳人民滿意醫(yī)院”“北京蕞受歡迎三甲醫(yī)院”榮譽稱號及“首都勞動獎狀”“全國五一勞動獎狀”。

在國內(nèi)率先開展了兒童正常腦發(fā)育和神經(jīng)障礙性疾病的多模態(tài)磁共振研究,首次利用酰胺質(zhì)子轉(zhuǎn)移成像和磁化轉(zhuǎn)移成像技術(shù)發(fā)現(xiàn)兒童腦白質(zhì)的游離蛋白含量隨著腦發(fā)育進程逐漸減低,提出APT成像技術(shù)可以用來監(jiān)測兒童的髓鞘化形成過程。2012年1月提出腦認知功能癱瘓概念(認知癱, Cognitive palsy, CP)，是繼Kanner之后對腦認知的重大推進。這是一個全新的精神病理學(xué)概念。目前正利用彌散張量磁共振成像技術(shù)建立0-2歲嬰幼兒腦白質(zhì)模板,以填充和彌補人類腦計劃中嬰幼兒腦發(fā)育的空白?