招標人必須在招標文件中明確規(guī)定出中標單位提交履約保證金時，此項條款方為有效，如果在招標書中沒有明確規(guī)定，在中標后不得追加。這就維護了招標中要約的真實性和投標人的權益，工程招標人可以根據(jù)自身的條件選擇對該項工程是否投標。因此，履約保證金具有選擇性。

資金來源不同。履約保證金一般來自承包方的流動資金，在施工前付給發(fā)包方。質量保證金是發(fā)包方與承包方在建設工程承包合同中約定或承包方在工程保修書中承諾，在工程竣工驗收交付使用后，從應付的建設工程款中預留的用以維修工程在保修期限和保修范圍內(nèi)出現(xiàn)的質量缺陷的資金。

保證金的比例和返還時間不同。履約保證金的比例為工程造價的5%-10%，具體執(zhí)行比例由發(fā)包人根據(jù)工程造價情況確定，承包人順利履行完畢自己的合同義務，發(fā)包人必須全額返還保證金。質量保證金比例可參照政府投資的建設項目的要求按工程造價5%左右預留保證金，具體比例雙方可協(xié)商，在工程竣工驗收交付使用后開始計算缺陷責任期，責任期內(nèi)承包人須認真履行合同約定的責任，到期后，承包人向發(fā)包人申請返還保證金。

借款保函是銀行應借款人要求向貸款方開立的保證借款人到期歸還貸款本息，否則由保證人進行賠付的書面擔保文件。借款保函的擔保金額一般為貸款總額及其利息之和，保函自開立之日起生效，至借款人償清全部本利總和之日失效。保函的擔保責任隨借款人的償還而自動遞減。