醫(yī)院擁有5位中國工程院院士，1百多名技術(shù)三級以上專家，1千多名高職專業(yè)技術(shù)人員。醫(yī)院先后獲得省部級以上科技成果獎勵1300余項，其中，國家科技進(jìn)步一等獎7項，二等獎20項，國家發(fā)明獎2項，軍隊科技進(jìn)步一等獎21項。 [2]

2017年11月11日下午，復(fù)旦大學(xué)醫(yī)院管理研究所正式發(fā)布了《2016年度中國醫(yī)院排行榜》和《2016年度中國醫(yī)院專科聲譽(yù)排行榜》，中國人民解放軍總醫(yī)院名列第三。

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先后牽頭并主持承擔(dān)了國家重大課題330多項。獲國家發(fā)明專利50余項。獲得新藥證書7項、診斷試劑生產(chǎn)批件13項、軍隊制劑批件43項。發(fā)表病毒性肝炎相關(guān)SCI論文800篇（IF≥10論文24篇）。依靠協(xié)同創(chuàng)新網(wǎng)絡(luò)推廣普及病毒性肝炎相關(guān)知識。一方面緊密瞄準(zhǔn)解決臨床問題“接地氣”的宏偉目標(biāo)，組織開展國際化、高質(zhì)量的多中心臨床研究，取得具有重大臨床指導(dǎo)意義的創(chuàng)新性成果，另一方面創(chuàng)新國際交流與合作模式，與世界大學(xué)、研究院所、醫(yī)療機(jī)構(gòu)和跨國企業(yè)等建立戰(zhàn)略合作伙伴關(guān)系，獲得具有“高大上”特性的科研成果，提高學(xué)術(shù)水平和地位。

國家骨科與運動康復(fù)臨床醫(yī)學(xué)研究中心由國家科技部、衛(wèi)健委、軍委后勤保障部和國家藥監(jiān)局于2019年5月正式批復(fù)成立，是目前國內(nèi)骨科與運動康復(fù)領(lǐng)域的臨床醫(yī)學(xué)研究中心。中心依托單位為中國人民解放軍總醫(yī)院，承載著強(qiáng)化醫(yī)學(xué)科技創(chuàng)新體系建設(shè)、打造國家臨床醫(yī)學(xué)和轉(zhuǎn)化研究“新高地”的重要使命與任務(wù)，始終堅持以臨床需求為牽引、以轉(zhuǎn)化應(yīng)用為導(dǎo)向、以創(chuàng)新網(wǎng)絡(luò)為支撐的工作思路，著力構(gòu)建全生命周期的創(chuàng)新生態(tài)平臺，開展臨床研究、協(xié)同創(chuàng)新、成果轉(zhuǎn)化、推廣應(yīng)用、學(xué)術(shù)交流、人才培養(yǎng)等工作。中心目前已開展臨床研究39項，發(fā)表論文600余篇，授權(quán)國際專利13項、國家專利120余項。牽頭/參與國內(nèi)指南、共識40余項，開展線上/線下教育，培訓(xùn)人員340余萬人次。開展千余次遠(yuǎn)程會診、扶貧幫帶，賦能地方醫(yī)療機(jī)構(gòu)骨科診療能力。