無菌工作區(qū)有用無菌操作臺，沒有的話也可以用潔凈工作臺代替。需要放置在離門遠的地方。

無菌實驗室設計的地面應使用、不滲水、不吸水、防滑、無裂隙且易于清洗的建筑材料鋪砌(如耐酸磚、水磨石、混凝土等)，地面應有適當坡度(以1.0~1.5%為宜)。

無菌實驗室專辟于微生物實驗室內(nèi)，室外室內(nèi)裝備的換氣設備必須有空氣過濾裝置。在獲得了無菌環(huán)境和無菌材料后，只有保持無菌狀態(tài)，才能對某種特定的已知微生物進行研究。所以控菌能力和控菌穩(wěn)定性是無菌室的核心驗收指標。業(yè)內(nèi)通行的驗收標準為100級潔凈區(qū)平板雜菌數(shù)平均不得超過1個菌落，10000級潔凈室平均不得超過3個菌落，在通行標準之外，還應該定期保養(yǎng)與維護。只有建設時合理的選材指標，合適凈化等級和長期管理與維護，才能使無菌實驗室發(fā)揮其應有的作用。

空氣調(diào)節(jié)系統(tǒng)必須可靠運行，采用先進技術，合理利用和節(jié)約能源與資源，保證環(huán)境的質(zhì)量和，為實驗人員提供所需要的溫度和濕度，保障生物實驗在的條件下進行，以確保實驗結(jié)果得準確性。同時它還必須控制實驗室的潔凈度，對新風進行過濾，使實驗室達到一定的凈化要求。其中排風系統(tǒng)是重點，對于保證實驗室相對負壓環(huán)境和有效過濾室內(nèi)污染排風起著重要的作用。

由于潔凈實驗室-生物實驗室的實驗對象是危險性的微生物，出于嚴格控制污染的原則，它要求以少的維護人員，運用化的管理維護手段，來實時監(jiān)控每一個實驗室中設備所處的物理環(huán)境，保證實驗室運行過程中始終處于相對負壓環(huán)境，防止危險性微生物外泄。