過濾系統(tǒng)包括兩方面，一方面是生化過濾，另一方面是物理過濾。

生化過濾：是以培養(yǎng)為主的過濾方式。

我們常見的就是水妖精(氣動式過濾器)以及上流行的氣舉。其原理就是以多孔隙的濾材上形成高氧區(qū)、水流體，用以培養(yǎng)硝化。

物理過濾：是以抽取缸中肉眼可見廢物。

通過較致密的過濾物，也就是我們常用的過濾棉，用以阻斷大顆粒的廢物再次回到缸內(nèi)。物理過濾過程中也包含有生化過濾過程，因?yàn)檫^濾棉上也會培養(yǎng)硝化生長。常見的就是上濾。

底部式過濾器：利用底砂砂層作為大體積的濾材(滲流濾層)，通過鋪設(shè)在砂層下的進(jìn)水管道網(wǎng)，經(jīng)由沉水水泵抽水，達(dá)到物理過濾及生化過濾的目地(原理類似于沉水式過濾器)因?yàn)V體較大，所以維護(hù)間格時 間較長，但維護(hù)極為不便。效果不錯，缺點(diǎn)是安裝較麻煩，還有草缸無法使用，會照成底肥的嚴(yán)重流失。

溢流式過濾器：一般用于裸缸養(yǎng)大型魚時采用(比如龍魚、羅流魚等)，此種過濾系統(tǒng)在理論上講可以免維護(hù)，但仍然需要人工來清理魚缸底部的廢物。此種過濾系統(tǒng)的缺點(diǎn)就是不美觀、體積較大!但其生化過濾系統(tǒng)效果!

魚缸里面的水因?yàn)榇罅课故?、排析物和魚身上的分秘物的產(chǎn)生，會有越來越多的有機(jī)物質(zhì)積累，這些有機(jī)質(zhì)廢物會凝聚、附著在缸壁上，而大量的都懸浮在水中或沉于底砂上。由于水溫高，有機(jī)物會加快腐敗，導(dǎo)致混濁度增加，水質(zhì)變壞，溶氧量明顯降低，氨及硝酸鹽大量增加，水會變得十分渾濁，魚在這樣的水中生活極易得病，甚到死亡。在魚缸中建成一個生態(tài)過濾系統(tǒng)，進(jìn)行有效的生態(tài)過濾，將有機(jī)質(zhì)分解，就可以減少這些附著物的產(chǎn)生，不僅將水中的固體廢物過濾清除，使水體變得十分清澈，水質(zhì)穩(wěn)定，還可以有效減少魚病的發(fā)生。