通常設(shè)計為三格化糞池，新鮮糞便由廁所管道進(jìn)入池，池內(nèi)糞便產(chǎn)生沼氣開始發(fā)酵分解，因比重不同糞便可分為三層，上層為比較濃的糞渣垃圾，下層為塊狀或顆粒狀糞渣，中層為比較清的糞液，在上層糞便和下層糞渣中含和寄生蟲卵多，中層含蟲卵少，初步發(fā)酵的中層糞液經(jīng)過化糞管流到第二格池，第二格池內(nèi)再化酵分解沉淀后溢流到第三格，第三格池再經(jīng)過沉淀過濾后清水流到下水管道。

貯糞池由二根過糞管連通的三個格室的密封池組成。根據(jù)其主要功能依次可命名為截留沉淀與發(fā)酵池、再次發(fā)酵池和貯糞池。三池之間由過糞管連接。有斜插管及倒U形、倒L形管等，但以斜插管為。過糞管采用內(nèi)徑為100～150mmPVC塑料管為宜，也可以用水泥預(yù)制、陶管等其它材料、要求內(nèi)壁光滑。為防止堵塞，考慮糞池的大小與流量，可適當(dāng)增加過糞管的數(shù)量。

化糞池的停留時間是關(guān)系污水處理效果和化糞池容積與造價的重要指標(biāo)。停留時間過短， 則污水處理效果差；停留時間過長，又增加化糞池容積與造價，且布置困難。停留時間的取定，應(yīng)兼顧污水處理效果與建設(shè)造價兩方面因素因考慮到發(fā)酵產(chǎn)生氣泡對沉淀要求的層流狀態(tài)的影響，化糞池流線轉(zhuǎn)折多對沉淀的不利影響，生活污水排放的瞬時變化大對進(jìn)水流量均勻的影響，化糞池的停留時間應(yīng)留有余地?！兑?guī)范》要求：停留時間取12～24小時。實踐證明：停留時間不宜少于12小時，以保證污水處理效果。

按照化糞池的技術(shù)標(biāo)準(zhǔn)，化糞池的污泥清掏時間一般為90天、180天、360天，被清掏的污泥可以作為有機(jī)肥料，或者進(jìn)行無害化處置。但是，隨著化肥的廣泛使用，社會的發(fā)展，使用糞便肥料越來越少，與此同時，我國污泥處置行業(yè)嚴(yán)重滯后，糞便污泥的無害化處理不足，我國13.6億人每年產(chǎn)生超億噸的糞便污泥，根據(jù)統(tǒng)計局?jǐn)?shù)據(jù)，2012年無害化處理的糞便污泥只有801.4萬噸。大量糞便污泥的清掏轉(zhuǎn)移，造成了二次污染。因此，如果不能解決化糞池污泥的無害化處置問題，化糞池污泥就會成為水污染的污染源，化糞池問題是關(guān)系水污染治理成效的環(huán)保問題。