無菌定義是要求沒有活體微生物的存在，為了達到無菌車間內沒有活體微生物，無菌車間在產品制造過程中需要采取各種方法來去除制品中原有的微生物和防止制品受到微生物的污染。

一個普通的無塵凈化車間，會涉及到凈化裝飾、地面、凈化空調與通風系統(tǒng)、冷熱源系統(tǒng)、照明系統(tǒng)、動力系統(tǒng)、通信系統(tǒng)、監(jiān)控系統(tǒng)、自動化控制系統(tǒng)、給排水系統(tǒng)、工藝管道系統(tǒng)等工程。

無菌潔凈車間的內部裝修要求房間圍護結構的空氣密封性好，房內無衛(wèi)生死角，裝修材料表面光潔但不反光、耐壓力而不起塵、易于清潔、不易發(fā)生霉變和長菌、能夠適應各種劑和氣體熏蒸的腐蝕和紫外線照射。

無塵無菌包裝分成大包裝和小包裝兩種，前者包裝容量為5-220L ，可到1000L，主要供食品廠家進行分裝銷售;后者包裝容量為70-1200ml，供市場銷售，直接供應消費者。

無塵無菌包裝包括包裝材料的無塵無菌、包裝產品的無塵無菌、包裝環(huán)境的無塵無菌和包裝后完整封合四個要素.“無塵無菌”表明了產品中不含任何影響產品質量 的微生物,“完整封合”表明了經過適當?shù)臋C械手段將產品封合到一定容積的包裝內,能防止微生物和氣體或水蒸汽進入包裝。

在獲得了無菌環(huán)境和無菌材料后，還要保持無菌狀態(tài)，才能對某種特定的已知微生物進行研究或利用它們的功能，否則外界的各種微生物很容易混入。外界不相干的微生物混入的現(xiàn)象，在微生物學中叫做污染雜菌。防止污染是微生物學工作中十分關鍵的技術。