在無菌車間中，使空間內(nèi)達到無菌要求，就是室內(nèi)環(huán)境控制的重點?？刂莆⑸锏纳L、殺滅或去除微生物的方法通常有兩種，一種為化學類，另一種為物理類。其中，化學方法有化學劑、氣化雙氧水、臭氧和環(huán)氧乙烷等;物理方法有濕熱或干熱、輻射和過濾等。

不論外在之空氣條件如何變化，其室內(nèi)均能俱有維持原先所設定要求之潔凈度、溫濕度及壓力等性能之特性。無塵車間主要之作用在于控制產(chǎn)品(如硅芯片等)所接觸之大氣的潔凈度日及溫濕度，使產(chǎn)品能在一個良好之環(huán)境空間中生產(chǎn)、制造，此空間我們稱之為無塵車間。

1、進入無塵無菌車間管理，包括對無塵無菌車間工作人員進入、物料進入、各類設備的搬入以及相關的設備、管線的維護管理，應做到不得將微粒、微生物帶入無塵無菌車間。

2、操作管理技術，對無塵無菌車間內(nèi)人員用潔凈工作服的制作、穿著和清洗;操作人員的移動和動作;室內(nèi)設備及裝修材料的選擇和清掃、滅茵等，盡可能地減少、防止無塵無菌車間內(nèi)塵粒、微生物的產(chǎn)生、滯留、繁殖等。

3、嚴格各類設備、設施的維護管理，制定相應的操作規(guī)程，保證各類設備、設施按要求正常運轉(zhuǎn)，包括凈化空調(diào)系統(tǒng)、各類水氣電系統(tǒng)、生產(chǎn)工藝設備和工器具(工裝夾具)等。以確保產(chǎn)品生產(chǎn)工藝要求和空氣潔凈度等級。

4、清掃、管理，對無塵無菌車間內(nèi)的各類設備、設施的清掃、滅茵以及方法、周期和檢查作明確的規(guī)定，防止、捎除無塵無菌車間內(nèi)塵粒、微生物的產(chǎn)生、滯留、繁殖。

5、無塵無菌車間環(huán)境控制的內(nèi)容包括：空氣凈化、潔凈建筑、與產(chǎn)品直接接觸的水或氣體或化學品和生產(chǎn)設備、工器具等的污染物控制以及微振動、噪聲、靜電的控制、防止等。

承接食品廠無菌車間工程，對超高溫有蒸煮味的物料可采用高溫短時，此種方法可較好保持產(chǎn)品的營養(yǎng)、風味，其典型應用是對牛乳制品的以及部份蔬菜制品。物料的冷方法是指根據(jù)不同場合各種劑或紫外線、輻射、微波照射等以達到目的。