無菌室應每月檢查菌落數(shù)。在超凈工作臺開啟的狀態(tài)下，取內徑90mm的無菌培養(yǎng)皿若干，無菌操作分別注入融化并冷卻至約45℃的營養(yǎng)瓊脂培養(yǎng)基約15ml，放至凝固后，倒置于30～35℃培養(yǎng)箱培養(yǎng)48小時，證明無菌后，取平板3～5個，分別放置工作位置的左中右等處，開蓋暴露30分鐘后，倒置于30～35℃培養(yǎng)箱培養(yǎng)48小時，取出檢查。100級潔凈區(qū)平板雜菌數(shù)平均不得超過1個菌落，10000級潔凈室平均不得超過3個菌落。如超過限度，應對無菌室進行徹底，直至重復檢查合乎要求為止。

無菌室內配置了百級超凈工作臺也并不是所有都可以進行實驗的，一般常規(guī)的菌落總數(shù)、微生物培養(yǎng)、血細胞培養(yǎng)、研究、干細胞研究、大腸菌等實驗可以在百級超凈臺進行。但是如果需要做致病，為了達到保護實驗室人員的問題，就必須得建造生物實驗室，使用生物柜進行實驗。該類實驗不能在普通的無菌實驗室中進行。

置換稀釋設計對潔凈區(qū)域的空氣凈化系統(tǒng)的設計有很高的要求，而且必須考慮無菌室的布局和操作方式，還要為關鍵區(qū)間提供合適的局部單向空氣流動保護，需要注意與空氣凈化系統(tǒng)供應的空氣一樣，滿布空氣過濾器的單向流動罩產(chǎn)生的空氣流動也可以置換稀釋房間中空氣傳播的微粒，這種空氣流動會增加有效的房間空氣交換率，并有助于污染空氣置換稀釋。

定期檢查室內空氣無菌狀況，數(shù)應控制在10個以下，發(fā)現(xiàn)不符合要求時，應立即徹底。/無菌室無菌程度的測定方法：取普通肉湯瓊脂平板、改良馬丁培養(yǎng)基平板各3個（平板直徑均9厘米），置無菌室各工作位置上，開蓋曝露半小時，然后倒置進行培養(yǎng)，測總數(shù)應置37℃溫箱培養(yǎng)48小時；測霉菌數(shù)則應置27℃溫箱培養(yǎng)5天。`霉菌總數(shù)均不得超過10個為 。