第二階段，認證取證階段。

經(jīng)過內(nèi)審和管理評審，組織如果確認其環(huán)境管理體系基本符合ISO14001標準要求，對組織適用性較好，且運行充分、有效，可向已獲得中國環(huán)境管理體系認證機構認可委員會認可有認證資格的認證機構提出認證申請并簽定認證合同，進入ISO14001環(huán)境管理體系認證審核階段。

認證審核是認證機構受組織委托，以第三方身份對組織的環(huán)境管理體系與ISO14001環(huán)境管理體系標準的符合性和運行、保持的有效性進行審核驗證，并確定是否向組織發(fā)放認證證書的過程。

為接受認證機構的認證審核，組織應做好充分準備，保持體系有效運行。認證機構會派出審核組，審核組將對組織實施認證審核。認證審核包括階段審核和第二階段現(xiàn)場審核。在組織完成第二階段現(xiàn)場審核開具的不符合糾正并經(jīng)過審核組驗證關閉后，機構經(jīng)過認證評定，將確定是否批準組織的認證注冊和頒發(fā)認證證書。

認證證書有效期三年，三年內(nèi)，組織要多次接受機構的監(jiān)督審核；三年后，組織要申請復審，重新注冊獲得證書，此過程同次認證取證。