收成果實后到出貨上市前要先去除外皮、果肉、賽果皮及銀皮。其方法有干燥式(也稱天然法或非水洗式)與水洗式兩種。

干燥式

方法較為單純。首先將剛采下的果實廣布在曬場上一兩個星期，直到果實發(fā)出霹啪的聲音為止，自然干燥之。之后，以脫殼機將干掉了的果肉、內果皮和銀皮去除。

以這種方式精制而成的咖啡豆，呈微酸而略有苦味。幾乎所有巴西產的咖啡豆、埃塞俄比亞、也門等地之咖啡豆都豆以這種方法取得的。這種方法的缺點是容易受天氣的影響，以及易摻入瑕疵豆和其它雜質。因此，必須細心地加以篩選才行。

水洗式

即將收成的果實放入流動的水槽，除去浮在水面的果實之后，以果肉去除機剝除外皮和果肉。再放入水槽，將浮出的果肉去除。之后，移入發(fā)酵槽，浸泡半天至，再將發(fā)酵的咖啡豆表面上的膠質溶掉。

再以水洗過后，曬干數(shù)日后以機器干燥之，后用脫殼機將內果皮去除，即成為可作為商品的生咖啡豆。用這種方式，會比干燥式的咖啡豆色澤較美，且雜質也較少。哥倫比亞、墨西哥、危地馬拉等國70%左右的產量都采用此方法。

方式對比

咖啡豆采收后就進行了處理程序，否則會開始發(fā)酵，使咖啡豆產生異味。處理的方法主要是“干燥式”和“水洗式”兩種，這兩種方法會造成不同的風味。干燥式的豆子有完整的自然醇味、溫柔的香氣與較多的膠質；水洗式則有不錯的醇味、高度的香氣和活潑的酸味，它也是濃縮咖啡里甜味的來源。