南方航空公司貨運(yùn)部（China Southern Cargo Airlines LTD.）簡(jiǎn)稱南航貨運(yùn)，是中國(guó)南方航空專職處理貨運(yùn)業(yè)務(wù)的部門，于1991年在廣州成立。

1991年2月1日，中國(guó)南方航空成立，并開(kāi)始與中國(guó)航空貨運(yùn)公司利用安-12貨機(jī)聯(lián)合經(jīng)營(yíng)貨物運(yùn)輸業(yè)務(wù)，重點(diǎn)對(duì)廣州白云機(jī)場(chǎng)貨物積壓的航線實(shí)行貨運(yùn)加班或包機(jī)飛行。同年10月，運(yùn)輸公司升格并改為南方航空公司營(yíng)運(yùn)部，貨運(yùn)科升格為貨運(yùn)處。

1996年1月4日，南航將貨運(yùn)處等部門聯(lián)合重組為運(yùn)輸部。5月4日，南航濕租俄羅斯貝加爾航空的兩架安－12貨機(jī)正式投入營(yíng)運(yùn)，兩架貨機(jī)首航天津，并陸續(xù)開(kāi)通廣州至成都、沈陽(yáng)、哈爾濱等航線。2000年3月，南航貨運(yùn)用濕租亞特拉斯航空的波音747-400型飛機(jī)開(kāi)通深圳-安克雷奇-芝加哥－深圳的貨運(yùn)航線，正式開(kāi)始使用全貨機(jī)經(jīng)營(yíng)。其自購(gòu)的首架波音747-400F型貨機(jī)于2002年6月開(kāi)始交付使用。